Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFCAB12Q6NXP0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms