Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP188Q5SRE5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms