Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NEXMIFQ5QGS0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEXMIFQ5QGS0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms