Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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