Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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