Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CNGA3Q16281 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNGA3Q16281 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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