Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms