Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CNN3Q15417 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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