Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NME3Q13232 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NME3Q13232 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME3Q13232 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME3Q13232 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME3Q13232 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME3Q13232 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME3Q13232 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NME3Q13232 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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NME3Q13232 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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NME3Q13232 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NME3Q13232 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NME3Q13232 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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