Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIK3Q13003 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIK3Q13003 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIK3Q13003 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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