Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms