Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms