Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN11Q06124 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms