Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHC1P78364 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHC1P78364 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHC1P78364 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHC1P78364 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHC1P78364 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHC1P78364 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHC1P78364 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHC1P78364 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHC1P78364 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHC1P78364 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHC1P78364 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms