Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVPABLB-1P60509 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms