Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP9P55211 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP9P55211 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP9P55211 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP9P55211 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP9P55211 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms