Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASP7P55210 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP7P55210 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP7P55210 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP7P55210 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP7P55210 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP7P55210 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP7P55210 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASP7P55210 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASP7P55210 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASP7P55210 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASP7P55210 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASP7P55210 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms