Protein–RNA interactions for Protein: P54868

HMGCS2, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS2P54868 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGCS2P54868 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGCS2P54868 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms