Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A2P52657 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms