Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UTRNP46939 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UTRNP46939 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UTRNP46939 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTRNP46939 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTRNP46939 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTRNP46939 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTRNP46939 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms