Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD11P31277 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD11P31277 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD11P31277 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD11P31277 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD11P31277 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD11P31277 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 RNU4-86P-201ENST00000410135 219 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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HOXD11P31277 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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HOXD11P31277 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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HOXD11P31277 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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HOXD11P31277 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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HOXD11P31277 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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HOXD11P31277 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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HOXD11P31277 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD11P31277 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
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