Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID4AP29374 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms