Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPREP23469 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPREP23469 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPREP23469 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPREP23469 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms