Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms