Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF3P18847 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF3P18847 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF3P18847 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF3P18847 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms