Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA4P12838 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms