Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD3P0DMS9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms