Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITX3O75364 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX3O75364 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX3O75364 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX3O75364 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms