Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VGFO15240 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VGFO15240 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VGFO15240 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VGFO15240 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VGFO15240 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VGFO15240 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VGFO15240 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
VGFO15240 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VGFO15240 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
VGFO15240 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VGFO15240 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VGFO15240 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VGFO15240 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VGFO15240 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VGFO15240 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VGFO15240 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VGFO15240 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VGFO15240 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VGFO15240 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VGFO15240 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VGFO15240 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms