Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFIT3O14879 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFIT3O14879 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms