Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC01387J3KSC0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms