Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L12C9JPN9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
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