Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC69A6NI79 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms