Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSDA5PKW4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms