Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV20-1A0A075B6N2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms