Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC133565.1-201ENST00000569218 488 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC136944.5-201ENST00000573021 151 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC004491.1-201ENST00000623029 1882 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RETREG1-202ENST00000399793 3145 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SCGB2A2-201ENST00000227918 505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NPIPA1-201ENST00000328085 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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TRIM35Q9UPQ4 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL354719.2-201ENST00000429530 1454 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K7CL-201ENST00000286791 1725 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AC091152.4-201ENST00000623480 3483 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 THEM5-201ENST00000368817 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRIM35Q9UPQ4 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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