Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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SH3BP4Q9P0V3 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SH3BP4Q9P0V3 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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