Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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