Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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SAMD8Q96LT4 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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SAMD8Q96LT4 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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SAMD8Q96LT4 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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SAMD8Q96LT4 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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SAMD8Q96LT4 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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SAMD8Q96LT4 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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SAMD8Q96LT4 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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SAMD8Q96LT4 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SAMD8Q96LT4 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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