Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms