Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP000907.3-201ENST00000530733 322 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FXNQ16595 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FXNQ16595 DCN-207ENST00000546370 586 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms