Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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VPS72Q15906 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
VPS72Q15906 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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