Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms