Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
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CNGB1Q14028 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
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CNGB1Q14028 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
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CNGB1Q14028 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
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CNGB1Q14028 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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CNGB1Q14028 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
CNGB1Q14028 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
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CNGB1Q14028 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
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CNGB1Q14028 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
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CNGB1Q14028 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
CNGB1Q14028 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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