Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CUL4BQ13620 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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