Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MTMR3Q13615 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms