Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
EIF4EBP1Q13541 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms