Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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