Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MAP3K19-205ENST00000392917 1765 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RPL12P27-201ENST00000414870 496 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OPRK1-204ENST00000524278 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR4A11P-201ENST00000529557 906 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 AP001442.1-201ENST00000617755 659 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 RAD21L1-203ENST00000409241 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TRIM51EP-201ENST00000524374 1516 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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