Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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